依托中国科学院南海海洋研究所的海洋区域中心于2011年12月通过中科院修购专项购进maXis Q-TOF超高分辨飞行时间液质联用仪。该仪器于2012年3月份进行了安装调试及试运行，并于7月份顺利通过了中科院的仪器验收。maXis Q-TOF高分辨质谱主要用来分析和鉴定海洋动植物和微生物代谢产生的天然活性物质，面向所内和所外用户提供测试分析服务。主要应用领域包括（1）海洋生物活性代谢产物化学分子式的精确测定，对未知有机天然产物给出准确的元素组成；（2）小分子代谢产物的代谢组学分析鉴定，目标代谢产物的鉴定和筛选；（3）海洋药物代谢及海洋生物功能蛋白质大分子的深度分析鉴定。所仪器设备公共服务中心运行该质谱仪一年以来，面向所内外单位提供分析测试服务，包括南海海洋研究所、华南植物园、湖南农业大学、广州医学院、南方医科大学、华南农业大学、广州牌牌生物科技有限公司等单位，总共测试化合物达1000多个，LCMS分析海洋生物样品200余份，总使用时间2601小时，总使用效率162.53%，总共享率87.30%。
该质谱仪器已经为国家973项目“海洋微生物的生理生态效应及其生物合成机制”，863计划重点课题“深海微生物活性物质挖掘及其利用技术”，国家杰出青年科学基金“微生物生理与生物化学” 等国家级课题重要数据的获取提供支撑。2012年南海所科研人员利用色谱质谱测试结果在JACS、Org. lett、ChemBioChem、J. Nat. Prod. 等化学和生物学领域发表科研论文二十多篇。获取的数据已经产生了深远、广泛的影响力，如项目负责人孙爱君和项目参与者张云用该仪器设备获取数据，以合作者身份在著名的天然产物化学杂志上发表论文“Cytotoxic angucycline class glycosides from the deep sea actinomycete Streptomyces lusitanus SCSIO LR32. J. Nat. Prod. 2012, 75, 202-208”，论文发表后立即引起国际同行的关注，美国Rutgers大学的Lutz和Falkowski教授在国际权威刊物Science杂志中的一篇视点文章里（Perspective: “A Dive to Challenger Deep”, 2012, 336: 301-302），指出这些研究属于“目前为数不多的从深海可培养放线菌中筛选和发现新颖活性次级代谢产物的优秀报道”。
